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恒遠(yuǎn)生物丨快收藏,相見(jiàn)恨晚的科研必備軟件
科研實(shí)驗(yàn)是一項(xiàng)非常繁瑣的工作,作為科研工作者不僅要有強(qiáng)大的耐心還要有強(qiáng)大的大腦。在生活中,善用各種工具能夠極大的提高我們的效率,在科研工作中亦是如此。學(xué)會(huì)使用軟件幫助自己,可以達(dá)到事半功倍的效果,小編今天給大家?guī)?lái)幾款網(wǎng)站或軟件,雖然不多,但都是可以節(jié)省很多時(shí)間的大殺器~~
1.Mendeley:文獻(xiàn)管家
面對(duì)數(shù)量眾多的文獻(xiàn),也許你還不知道如何管理,也許你還在為下不到 Endnote 而發(fā)愁,今天我來(lái)給大家安利一款免費(fèi)又好用的科研文獻(xiàn)管理神器—Mendeley。
Mendeley是一款免費(fèi)的跨平臺(tái)文獻(xiàn)管理軟件,同時(shí)也是一個(gè)在線的學(xué)術(shù)社交網(wǎng)絡(luò)平臺(tái)??梢绘I抓取網(wǎng)頁(yè)上的文獻(xiàn)信息添加到個(gè)人的library中。還可安裝MS Word和Open Office插件,方便在文字編輯器中插入和管理參考文獻(xiàn)。參考文獻(xiàn)格式與Zotero一樣用各種期刊格式的CLS文件。Mendeley還免費(fèi)提供各2GB的文獻(xiàn)存儲(chǔ)和100MB的共享空間
官網(wǎng):https://www.mendeley.com
2. Endnote:經(jīng)典文獻(xiàn)管理工具
Endnote是一款文獻(xiàn)管理和編輯軟件,支持國(guó)際期刊的參考文獻(xiàn)格式有3776種,寫作模板幾百種,涵蓋各個(gè)領(lǐng)域的雜志。如果您準(zhǔn)備寫SCI稿件,可以幫助你在論文中管理你想要插入的參考文獻(xiàn),統(tǒng)一更改文獻(xiàn)的格式。對(duì)于想要針對(duì)性的投稿某家雜志的文章,還可以下載該雜志的參考文獻(xiàn)引用格式
下載:在百度中搜索“Endnote x9”,點(diǎn)第一個(gè)鏈接進(jìn)入下載頁(yè)面。軟件大小為108MB,下載的是一個(gè)壓縮包,如下圖所示,雙擊解壓之后是右側(cè)的圖標(biāo),解壓到文件夾,雙擊即可安裝。
3.DNAman:生信數(shù)據(jù)的挖掘機(jī)
dnaman軟件是一款高度集成化的分子生物學(xué)綜合應(yīng)用軟件,dnaman軟件可以用于多序列比對(duì)、PCR引物設(shè)計(jì)、限制性酶切分析、質(zhì)粒繪圖、蛋白質(zhì)分析等,幾乎囊括了所有日常核酸、蛋白質(zhì)序列的分析工作。
4.DNASTAR:強(qiáng)大的序列分析軟件
DNASTAR是一款綜合性序列工具軟件,特點(diǎn)是操作簡(jiǎn)單,功能強(qiáng)大。實(shí)驗(yàn)室必備軟件,主要功能:序列的格式轉(zhuǎn)換,序列拼接和重疊克隆群的處理;基因?qū)ふ?;蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域的查找;多重序列的比較和兩兩序列的比較;PCR引物,測(cè)序引物等。DNASTAR是哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院使用的序列分析軟件,可見(jiàn)其功能強(qiáng)大。
5.Oligo:強(qiáng)大的引物設(shè)計(jì)軟件
Oligo是目前最好、最專業(yè)的引物設(shè)計(jì)軟件,功能很強(qiáng),主要功能包括普通引物對(duì)的搜索、測(cè)序引物的設(shè)計(jì)、雜交探針的設(shè)計(jì)以及評(píng)估引物對(duì)質(zhì)量等。尤其可與Primer Premier配合使用,前者搜索引物,Oligo進(jìn)行評(píng)價(jià)分析。
6.FlowJo:流式細(xì)胞的行業(yè)標(biāo)桿
FlowJo是一款優(yōu)秀的流式細(xì)胞分析專業(yè)軟件,可以兼容幾乎所有流式儀器采集的數(shù)據(jù)。它簡(jiǎn)單易用,功能強(qiáng)大,是流式領(lǐng)域最受推薦的一款專業(yè)分析軟件,也是各高影響力科學(xué)期刊使用最多的軟件,已經(jīng)成了行業(yè)的一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)。
功能:
①階梯式設(shè)門:將細(xì)胞群之間的邏輯關(guān)系用簡(jiǎn)單、遞進(jìn)的階梯式去呈現(xiàn),一改傳統(tǒng)復(fù)雜的邏輯門設(shè)置。并可以自定義細(xì)胞群名稱,進(jìn)而直觀的顯示細(xì)胞群統(tǒng)計(jì)值,讓分析結(jié)果一目了然。
②多種圖像顯示方法及顯示類型:顯示方法:它可以呈現(xiàn)為一維的直方圖,二維圖及三維立體圖。
③多種設(shè)門工具:
設(shè)門是流式數(shù)據(jù)分析中界定細(xì)胞目標(biāo)群的必要手段,不管檢測(cè)的目標(biāo)細(xì)胞群是規(guī)則分布還是不規(guī)則分布的,是小概率事件還是集體事件,都可以很方便的界定各種細(xì)胞群。